Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITRM1Q5JRX3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms