Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms