Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSP90AA4PQ58FG1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HSP90AA4PQ58FG1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HSP90AA4PQ58FG1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSP90AA4PQ58FG1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSP90AA4PQ58FG1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSP90AA4PQ58FG1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms