Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms