Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPIN4Q56A73 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms