Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL22Q53GT1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms