Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms