Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LTC4SQ16873 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms