Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLPPQ16740 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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