Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKN3Q16667 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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