Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FXNQ16595 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FXNQ16595 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXNQ16595 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXNQ16595 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FXNQ16595 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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