Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SGCAQ16586 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SGCAQ16586 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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