Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A3Q16572 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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