Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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