Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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