Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms