Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms