Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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