Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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LAPTM4AQ15012 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAPTM4AQ15012 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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