Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms