Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NFIXQ14938 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms