Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC3Q14574 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSC3Q14574 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSC3Q14574 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSC3Q14574 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSC3Q14574 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSC3Q14574 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSC3Q14574 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms