Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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