Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM53BQ14153 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms