Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CBFBQ13951 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CBFBQ13951 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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