Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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DDX39BQ13838 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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DDX39BQ13838 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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DDX39BQ13838 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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DDX39BQ13838 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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DDX39BQ13838 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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