Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms