Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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