Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms