Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms