Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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