Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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IFT88Q13099 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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IFT88Q13099 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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IFT88Q13099 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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IFT88Q13099 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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