Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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