Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms