Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXF1Q12946 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXF1Q12946 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXF1Q12946 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXF1Q12946 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXF1Q12946 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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