Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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