Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms