Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms