Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEUP1Q05D60 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms