Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms