Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms