Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms