Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms