Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNTN2Q02246 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN2Q02246 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms