Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms