Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XPCQ01831 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XPCQ01831 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms