Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms