Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms