Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms