Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms